PANELES Y GENES EN GENETICA PEDIATRICA
ENFERMEDADES POCO FRECUENTES:
•Las Enfermedades Poco Frecuentes (EPOF) son aquellas que afectan a un número limitado de personas con respecto a la población en general. Se consideran EPOF cuando afectan a 1 persona cada 2.000 habitantes. En su mayoría son de origen genético, crónicas, degenerativas y, en muchos casos, pueden producir algún tipo de discapacidad. Una gran cantidad son graves y ponen en serio riesgo la vida de los pacientes sino se las diagnostica a tiempo y se las trata de forma adecuada
•La OMS estima que mundialmente hay 7000 enfermedades poco frecuentes identificadas, cuya incidencia en la población mundial es entre el 6 y el 8%. Si bien se caracterizan por la baja prevalencia de cada una de ellas, la cantidad de afectados por dichas enfermedades en Argentina es de aproximadamente 3.200.000 personas. En nuestro país aún no existe un registro formal de enfermedades poco frecuentes.
•Las EPOF se caracterizan por una gran diversidad de patologías y síntomas, que no sólo varían entre ellas, sino que también se manifiestan de diferente manera en pacientes afectados por la misma enfermedad.
La identificación de la mutación causal de una enfermedad mendeliana permite el diagnóstico molecular y el análisis de portadores
•Es de gran importancia para el manejo del paciente, el asesoramiento genético familiar y probables estrategias terapéuticas
ESTUDIOS MOLECULARES EN GENETICA PEDIATRICA –
ENFERMEDADES POCO FRECUENTES (EPOF)
Se listan a continuación los principales paneles de genes disponibles. Es posible la incorporación de otros genes al estudio, o la realización de estudios sobre genes específicos. En estos casos, le solicitamos se contacte con nosotros para evaluar las posibilidades técnicas
CILIOPATIAS
PANEL DE CILIOPATIAS (102 genes)
AHI1 – ANKS6 – ARL13B – ARL6 – ARMC4 – B9D1 – B9D2 – BBS1 – BBS10 – BBS12 – BBS2 – BBS4 – BBS5 – BBS7 – BBS9 – C21orf59 – C5orf42 – CC2D2A – CCDC103 – CCDC114 – CCDC151 – CCDC39 – CCDC40 – CCDC65 – CCNO – CEP104 – CEP120 – CEP164 – CEP290 – CEP41 – CEP83 – CSPP1 – DCDC2 – DNAAF1 – DNAAF2 – DNAAF3 – DNAAF5 – DNAH1 – DNAH11 – DNAH5 – DNAH8 – DNAI1 – DNAI2 – DNAL1 – DRC1 – DYNC2H1 – DYX1C1 – EVC – EVC2 – GAS8 – GLIS2 – IFT122 – IFT140 – IFT172 – IFT80 – INPP5E – INVS – IQCB1 – KIAA0586 – KIF7 – LRRC6 – MCIDAS – MKKS – MKS1 – MRE11 – NEK1 – NEK8 – NME8 – NPHP1 – NPHP3 – NPHP4 – OFD1 – PDE6D – PKD2 – PKHD1 – RPGR – RPGRIP1L – RSPH1 – RSPH3 – RSPH4A – RSPH9 – SDCCAG8 – SPAG1 – TCTN1 – TCTN2 – TCTN3 – TMEM138 – TMEM216 – TMEM231 – TMEM237 – TMEM67 – TRIM32 – TTC21B – TTC8 – WDPCP – WDR19 – WDR34 – WDR35 – WDR60 – XPNPEP3 – ZMYND10 – ZNF423
PANEL DE CILIOPATIAS ESQUELETICAS (18 genes)
CSPP1 – DYNC2H1 – EVC – EVC2 – IFT122 – IFT140 – IFT172 – IFT80 – KIAA0586 – NEK1 – TCTN3 – TTC21B – WDR19 – WDR34 – WDR35 – WDR60 – Se puede agregar el gen FGFR3- asociado a Displasia Tanatoforica
PANEL DE DISKINESIA CILIAR PRIMARIA ( 36 genes)
ARMC4 – C21orf59 – CCDC103 – CCDC114 – CCDC151 – CCDC39 – CCDC40 – CCDC65 – CCNO – DNAAF1 – DNAAF2 – DNAAF3 – DNAAF5 – DNAH1 – DNAH11 – DNAH5 – DNAH8 – DNAI1 – DNAI2 – DNAL1 – DRC1 – DYX1C1 – GAS8 – LRRC6 – MCIDAS – NME8 – OFD1 – RPGR – RSPH1 – RSPH3 – RSPH4A – RSPH9 – SPAG1 – ZMYND10 – Se pueden agregar el gen INVS con evidencia clínica preliminar, y el gen CFTR de Fibrosis quística
PANEL DE SINDROME BARDET-BIEDL (16 genes)
ARL6 – BBS1 – BBS10 – BBS12 – BBS2 – BBS4 – BBS5 – BBS7 – BBS9 – CEP290 – MKKS – MKS1 – SDCCAG8 – TRIM32 – TTC8 – WDPCP
PANEL DE SINDROME JOUBERT Y MECKEL-GRUBER (30 genes)
AHI1 – ARL13B – B9D1 – B9D2 – C5orf42 – CC2D2A – CEP104 – CEP290 – CEP41 – CSPP1 – INPP5E – KIAA0586 – KIF7 – MKS1 – MRE11 – NPHP1 – NPHP3 – OFD1 – PDE6D – RPGRIP1L – TCTN1 – TCTN2 – TCTN3 – TMEM138 – TMEM216 – TMEM231 – TMEM237 – TMEM67 – TTC21B – ZNF423
PANEL DE NEFRONOPTISIS (27 genes)
AHI1 – ANKS6 – CC2D2A – CEP164 – CEP290 – CEP83 – DCDC2 – GLIS2 – IFT172 – INVS – IQCB1 – NEK8 – NPHP1 – NPHP3 – NPHP4 – OFD1 – PKHD1 – RPGRIP1L – SDCCAG8 – TCTN1 – TMEM216 – TMEM237 – TMEM67 – TTC21B – WDR19 – XPNPEP3 – ZNF423
SINDROME ORAL-FACIAL-DIGITAL TIPO 1 (1 gen)
OFD1
PANEL DE POLIQUISTOSIS RENAL (2 genes)
PKD2 – PKHD1
PANEL DE SINDROME SENIOR-LOKEN (8 genes)
CEP290 – INVS – IQCB1 – NPHP1 – NPHP3 – NPHP4 – SDCCAG8 – WDR19
DEFECTOS CARDIACOS
PANEL DE DEFECTOS CONGENITOS DEL CORAZON Y HETEROTAXIA (89 genes)
PANEL PRIMARIO:
ACTC1 – ACVR2B – ALMS1 – ANKS6 – ARMC4 – BBS10 – BCOR – BRAF – C21orf59 – CBL – CCDC103 – CCDC114 – CCDC151 – CCDC39 – CCDC40 – CCDC65 – CCNO – CEP290 – CFAP53 – CHD7 – DNAAF1 – DNAAF2 – DNAAF3 – DNAAF5 – DNAH1 – DNAH11 – DNAH5 – DNAH8 – DNAI1 – DNAI2 – DNAL1 – DRC1 – DYX1C1 – ELN – FOXH1 – GAS8 – GATA4 – GDF1 – GJA1 – GPC3 – HRAS – INVS – JAG1 – KRAS – LEFTY2 – LRRC6 – MAP2K1 – MAP2K2 – MCIDAS – MED13L – MEIS2 – MKS1 – NEK8 – NF1 – NKX2-5 – NKX2-6 – NME8 – NODAL – NOTCH1 – NOTCH2 – NPHP3 – NR2F2 – NRAS – NSD1 – OFD1 – PTPN11 – RAF1 – RIT1 – RPGR – RSPH1 – RSPH3 – RSPH4A – RSPH9 – SHOC2 – SOS1 – SPAG1 – TBX1 – TBX5 – TTC8 – ZIC3 – ZMYND10 – ZNF423
GENES CON EVIDENCIA PRELIMINAR DE ASOCIACIÓN CLÍNICA:
CFAP52 – CRELD1 – GATA6 – HAND1 – MYH6 – SMAD6 – ZFPM2
FIBROSIS QUISTICA Y PANCREATITIS
PANEL DE FIBROSIS QUISTICA Y PANCREATITIS CRONICA (1 Ó 5 GENES)
FIBROSIS QUISTICA: CFTR
PANCREATITIS CRONICA: CASR – CTRC – PRSS1 – SPINK1
DESORDENES DEL DESARROLLO
PANEL DE SINDROME ALAGILLE (2 genes)
JAG1 – NOTCH2
PANEL DE SINDROME CEREBROCRANEOFACIAL BARAITSER-WINTER (2 genes)
ACTB – ACTG1
PANEL DE SINDROME BRANQUIO-OTO-RENAL (3 genes)
EYA1 – SIX1 – Se agrega el gen SALL1 asociado al sindrome Townes-Brocks
PANEL DE SINDROME CARPENTER (2 genes)
MEGF8 – RAB23
TEST DE HIPERCALCEMIA – HIPOCALCIURIA FAMILIAR AUTOSOMICA DOMINANTE (1 gen)
CASR
TEST DE SINDROME CHARGE (1 gen)
CHD7
TEST DE SINDROME CHOPS (1 gen)
AFF4
TEST DE SINDROME COFFIN-LOWRY (1 gen)
RPS6KA3
TEST DE SINDROME COHEN (1 gen)
VPS13B
PANEL DE SINDROME CORNELIA DE LANGE (6 genes)
HDAC8 – NIPBL – RAD21 – SMC1A – SMC3 – Se agrega el gen EP300 de evidencia clínica preliminar
TEST DE SINDROME GLASS (1 gen)
SATB2
TEST DE DESORDENES RELACIONADOS A GLI3 (CEFALOPOLISINDACTILIA DE GREIG, SINDROME PALLISTER-HALL, POLIDACTILIA POSTAXIAL A Y B Y POLIDACTILIA PREAXIAL TIPO IV (1 gene)
GLI3
TEST DE HPRT-1 (1 gen)
HPRT1
PANEL DE DEFICIENCIA AISLADA DE HORMONA LIBERADORA DE GONADOTROFINA (3 genes)
ANOS1 – CHD7 – FGFR1
PANEL DE SINDROME KABUKI (2 genes)
KDM6A – KMT2D
TEST DE KAT6B (SINDROME SAY-BARBER-BIESECKER-YOUNG-SIMPSON Y SINDROME GENITOPATELAR) (1 gen)
KAT6B
TEST DE SINDROME KBG (1 gen)
ANKRD11
TEST DE MED12 (1 gen)
MED12
TEST DE SINDROME OCULO-FACIAL-CARDIO-DENTAL (1 gen)
BCOR
TEST DE PTEN (1 gen)
PTEN
TEST DE SINDROME RENPENNING (1 gen)
PQBP1
PANEL DE SINDROME RUBINSTEIN-TAYBI (2 genes)
CREBBP – EP300
TEST DE SINDROME SIMPSON-GOLOBI-BEHMEL (1 gen)
GPC3
TEST DE SINDROME SOTOS (1 gen)
NSD1
PANEL DE SINDROME VAN DER WOUDE (2 genes)
GRHL3 – IRF6
TEST DE VON HIPPEL-LINDAU (1 gen)
VHL
PANEL DE SINDROME WARG (2 genes)
PAX6 – WT1
TEST DE SINDROME WEAVER (1 gen)
EZH2
DESORDENES DEL DESARROLLO SEXUAL / ENDOCRINOLOGIA
PANEL DE DESORDENES DEL DESARROLLO SEXUAL MASCULINO (15 genes)
PANEL PRIMARIO:
AR – DHH – MAP3K1 – NR0B1 – NR5A1 – SRD5A2 – SRY – WT1
SE AGREGAN GENES DE SINDROME DE KALLMAN:
ANOS1 – CHD7 – FGFR1 – HESX1; de Alfa talasemia ligada a X: ATRX ; de Displasia Campomélica SOX9; de Sindrome Smith-Lemli-Opitz DHCR7
TEST DE DESORDENES DEL DESARROLLO SEXUAL FEMENINO (1 gene)
SRY
PANEL DE INSENSIBILIDAD A LOS ANDROGENOS (2 genes)
AR – SRD5A2
PANEL DE DEFICIENCIA AISLADA DE HORMONA LIBERADORA DE GONADOTROFINA (3 genes)
ANOS1 – CHD7 – FGFR1
SINDROMES DE SOBRECRECIMIENTO
PANEL DE SOBRECRECIMIENTO Y MACROCEFALIA ( 25 genes)
PANEL PRIMARIO:
AKT2 – AKT3 – CDKN1C – CUL4B – DIS3L2 – DNMT3A – EZH2 – GLI3 – GPC3 – KPTN – MED12 – NF1 – NFIX – NPR2 – NSD1 – PHF6 – PIK3R2 – PTEN – SETD2 – SPRED1
GENES DE EVIDENCIA CLÍNICA PRELIMINAR:
DICER1 – EED – PDGFRB – RNF125 – UPF3B
TEST DE SINDROME PERLMAN (1 gen)
DIS3L2
TEST DE SINDROME PROTEUS (1 gen)
AKT1
TEST DE PTEN (1 gen)
PTEN
TEST DE SINDROME SIMPSON-GOLABI-BEHMEL (1 gen)
GPC3
TEST DE SINDROME SOTOS (1 gen)
NSD1
TEST DE SINDROME WEAVER (1 gen)
EZH2
RASOPATIAS (DESORDENES DEL ESPECTRO NOONAN)
PANEL DE RASOPATIAS (18 genes)
A2ML1 – BRAF – CBL – HRAS – KRAS – MAP2K1 – MAP2K2 – NF1 – NRAS – PTPN11 – RAF1 – RASA1 – RIT1 – RRAS – SHOC2 – SOS1 – SOS2 – SPRED1
TEST DE SINDROME COSTELLO (1 gen)
HRAS
PANEL DE SINDROME CARDIO-FACIO-CUTANEO (6 genes)
BRAF – KRAS – MAP2K1 – MAP2K2 – SHOC2 – SOS1
PANEL DE SINDROME LEGIUS (2 genes)
SPRED1 – Se agrega gen de Neurofibromatosis tipo 1 NF1
PANEL DE SINDROME NOONAN (16 genes)
PANEL PRIMARIO:
A2ML1 – BRAF – CBL – KRAS – MAP2K1 – MAP2K2 – NRAS – PTPN11 – RAF1 -RIT1 – RRAS – SHOC2 – SOS1 – SOS2
SE AGREGAN GENES DE SINDROME BARAITSER-WINTER:
ACTB – ACTG1
PANEL DE GENES DE SINDROME NOONAN CON LENTIGOS MULTIPLES (3 genes)
BRAF – PTPN11 – RAF1
DISPLASIAS ESQUELETICAS
TEST DE SINDROME ANTLEY-BIXLER (1 gen)
POR
TEST DE FGFR2 – CRANIOSINOSTOSIS (1 gen)
FGFR2
TEST DE CONDRODISPLASIA PUNCTATA (1 gen)
ARSE
TEST DE NSDHL (1 gen)
NSDHL
TEST DE DISPLASIA CAMPOMELICA (1 gen)
SOX9
PANEL DE CRANIOSINOSTOSIS (11 genes)
ERF – FGFR1 – FGFR2 – FGFR3 – GLI3 – MEGF8 – MSX2 – RAB23 – TWIST1 – MASP1 – TCOF1
TEST DE SINDROME DUANE-RADIAL RAY (1 gene)
SALL4
PANEL DE DISOSTOSIS ACROFACIAL DE WEYERS Y ELLIS VAN CREVELD (2 genes)
EVC – EVC2
TEST DE FDFR3 (1 gen)
FGFR3
PANEL DE OSTEOCONDROMAS HEREDITARIOS MULTIPLES ( 3 genes)
EXT1 – EXT2 Se agrega el gen de Sindrome Langer-Giedion : TRPS1
TEST DE SINDROME HOLT-ORAM ( 1 gen)
TBX5
PANEL DE OSTEOGENESIS IMPERFECTA (4 genes)
COL1A1 – COL1A2 – CRTAP – P3H1
TEST DE NSDHL (1 gen)
NSDHL
PANEL DE CILIOPATIAS ESQUELETICAS (18 genes)
CEP120 – CSPP1 – DYNC2H1 – EVC – EVC2 – IFT122 – IFT140 – IFT172 – IFT80 – KIAA0586 – NEK1 – TCTN3 – TTC21B – WDR19 – WDR34 – WDR35 – WDR60 – FGFR3
TEST DE SINDROME TAR (1 gen)
RBM8A
TEST DE SINDROME TOWNES-BROCKS (1 gen)
SALL1
TEST DE SINDROME DE TRACHER COLLINS (1 gen)
TCOF1
TEST DE SINDROME TRICORINOFARINGEO (2 genes)
EXT1 – TRPS1
TEST DE SINDROME ULNAR-MAMMARY (1 gen)
TBX3
DERMATOLOGÍA
PANEL DE SINDROME CARDIO-FACIO-CUTANEO (6 genes)
BRAF – KRAS – MAP2K1 – MAP2K2 – SHOC2 – SOS1
PANEL DE DISPLASIA ECTODERMICA CON O SIN AGENESIA DENTARIA (10 genes)
EDA – EDAR – EDARADD – LTBP3 – MSX1 – NFKBIA – PAX9 – WNT10A – GJB6 – TP63
TEST DE SINDROME LEGIUS (1 gen)
SPRED1
TEST DE NEUROFIBROMATOSIS TIPO 1 (1 gen)
NF1
PANEL DE SINDROME NOONAN CON LENTIGO MULTIPLES (3 genes)
BRAF – PTPN11 – RAF1
TEST DE PTEN (1 gen)
PTEN
TEST DE TP63 (1 gen)
TP63
SINDROME WOUDE (2 genes)
GRHL3 – IRF6
CANCER HEREDITARIO – ONCOLOGIA PEDIATRICA
PANEL DE TUMORES SOLIDOS PEDIATRICOS (48 genes)
ALK – APC – AXIN2 – BAP1 – BLM – BMPR1A – CDC73 – CDKN1C – DICER1 – DIS3L2 – EPCAM – FH – GPC3 – HRAS – MAX – MEN1 – MLH1 – MSH2 – MSH6 – NBN – NF1 – NF2 – PHOX2B – PMS2 – PRKAR1A – PTCH1 – PTEN – RB1 – RECQL4 – RET – SDHA – SDHAF2 – SDHB – SDHC – SDHD – SMAD4 – SMARCA4 – SMARCB1 – SMARCE1 – STK11 – SUFU – TMEM127 – TP53 – TSC1 – TSC2 – VHL – WRN – WT1
TEST DE RETINOBLASTOMA (1 gen)
RB1
DESORDENES METABOLICOS
PANEL DE DESORDENES METABOLICOS (229 GENES)
ABCD1 – ABCD4 – ACAD8 – ACADM – ACADS – ACADSB – ACADVL – ACAT1 – ACSF3 – AHCY – ALDH4A1 – ARG1 – ASL – ASS1 – AUH – BCKDHA – BCKDHB – BTD – CBS – CD320 – CFTR – CPS1 – CPT1A – CPT2 – DBT – DNAJC19 – ETFA – ETFB – ETFDH – ETHE1 – FAH – FTCD – G6PD – GAA – GALE – GALK1 – GALT – GCDH – GCH1 – GLA – GNMT – GSS – HADH – HADHA – HADHB – HCFC1 – HLCS – HMGCL – HPD – HSD17B10 – IDUA – IVD – LMBRD1 – MAT1A – MCCC1 – MCCC2 – MCEE – MLYCD – MMAA – MMAB – MMACHC – MMADHC – MTR – MTRR – MUT – NAGS – OAT – OPA3 – OTC – PAH – PC – PCBD1 – PCCA – PCCB – PPM1K – PRODH – PTS – QDPR – SERAC1 – SLC22A5 – SLC25A13 – SLC25A15 – SLC25A20 – SMPD1 – SPR – SUCLA2 – SUCLG1 – TAT – TAZ – TMEM70 – DECR1 – NADK2 – GAMT – GATM – SLC6A8ALG1 – ALG11 – ALG12 – ALG13 – ALG14 – ALG2 – ALG3 – ALG6 – ALG8 – ALG9 – ATP6V0A2 – B3GALNT2 – B3GALT6 – B3GAT3 – B3GLCT – B4GALNT1 – B4GALT1 – B4GALT7 – B4GAT1 – C1GALT1C1 – CHST14 – CHST3 – CHST6 – CHSY1 – COG1 – COG2 – COG4 – COG5 – COG6 – COG7 – COG8 – DDOST – DHDDS – DOLK – DPAGT1 – DPM1 – DPM2 – DPM3 – DSE – EOGT – EXT1 – EXT2 – FKRP – FKTN – G6PC3 – GALNT3 – GFPT1 – GMPPA – GMPPB – GNE – ISPD – LARGE1 – LFNG – MAGT1 – MAN1B1 – MGAT2 – MOGS – MPDU1 – MPI – NGLY1 – NUS1 – PAPSS2 – PGM1 – PGM3 – PIGA – PIGL – PIGM – PIGN – PIGO – PIGQ – PIGT – PIGV – PIGW – PMM2 – POFUT1 – POGLUT1 – POMGNT1 – POMGNT2 – POMK – POMT1 POMT2 RFT1 – RPN2 – SEC23A – SEC23B – SLC26A2 – SLC35A1 – SLC35A2 – SLC35A3 – SLC35C1 – SLC35D1 – SRD5A3 – SSR4 – ST3GAL3 – ST3GAL5 – STT3A – STT3B – TMEM165 – TMEM5 – TRIP11 – TUSC3 – XYLT1 – ARSA – ASPA – GALC – GM2A – HEXA – HEXB – SLC2A1AMT – GCSH – GLDC – LIAS – NFU1 – SLC6A9 – IDS – NPC1 – NPC2 – PNPO – ALDH7A1 – DHCR7 – CYP27A1 – HMGCS2 – OXCT1 – ATP13A2 – CLN2 (TPP1) – CLN3 – CLN5 – CLN6 – CLN8 – CTSD – KCTD7 – MFSD8 – PPT1